文山州药用植物资源十分丰富，在全州已查明的268科923属4504种植物中，有药用植物649种。根据文山州《医药志》的记载，文山州常年收购的大宗中药材有三七、石斛（包括黄草、园石斛、小瓜石斛、黑节草等）、灯盏细辛、钩藤、半夏、重楼、桔梗、茯苓、龙胆草、八角、草果等十多种。 1、三七是文山独有的中药资源，种植面积和产量均占到了全国的98%，2010年，文山三七产业产值达到30亿园左右。经过近几年文山人不断的努力，三七的市场需求量在逐步提高。据不完全统计，我国现有医药工业企业3613家，其中中药制药企业1283家，截止2006年底全国使用三七为原料生产的中成药品种302个，批准文号多达3207个，生产厂家达1000余家，覆盖全国29个省市、自改善区，几乎覆盖了所有的中药制药企业。许多著名的企业如云南白药、天津天士力、广东丽珠得乐，漳州片仔癀、广州白云山都是三七的需求大户。目前社会需求量700万公斤，2010年产量450万公斤。 2、八角主要分布在文山、红河、德宏、保山等湿热地区，种植最多的是文山州。文山州种植八角已有700多年的历史，经过多年来的培育、巩固和发展，全州八角种植面积已发展到70多万亩，产量1400万公斤，主要集中在富宁、广南、麻栗坡、西畴和马关等县。近年来，文山、砚山等县也开始发展种植。八角是文山州的传统特色资源，是各族农民群众的“摇钱树”。 3、重楼为百合科植物，具有清热解毒、消肿止痛、凉肝定惊的功效，常用于改善肿痛、跌打损伤等疾病，是云南白药的主要成分之一。由于重楼的市场供应一直靠采挖野生药材，近几年野生资源量大大减少。据调查，目前我国重楼市场需求量为200万公斤，但供应量仅为2到3万公斤。重楼资源的奇缺已经成为制药云南白药发展的瓶颈。重楼云南省重点发展的稀缺药材保护品种。全州八县均有分布，现有面积0.095万亩，产量6.7万公斤。麻栗坡、文山、砚山和广南县进行人工试种。 4、灯盏花为菊科植物，分布于我国西南省区，云南为主要产区。民间用于改善脑血管后遗症引起的偏瘫。主要含黄酮类成分，称为灯盏素，其注射液用于改善高血压、脑栓塞有很好的疗效。目前我国灯盏素的产量在5000公斤左右，市场需求量为1万公斤，由于野生灯盏花采集过度，资源面临枯竭，只有进行人工栽培才能解决市场供应和质量稳定的问题。州内现有面积0.78万亩，产量10.1万公斤，全州八县均有分布。邱北、文山、广南、砚山、富宁等县进行人工试种，种植面积101亩。 5、辣椒。主要分布在丘北、砚山、文山等县。州内有辣椒加工企业13户,年生产规模可达6000吨,主要生产辣椒圈（丝）、油辣椒等系列产品。建有“云南丘北辣椒交易中心”和“云南稼依辣椒城”等交易场所，可进行现货、期货和网上交易。丘北辣椒，国内外都有一定的知名度,主要出口美国、日本、新加坡、韩国、加拿大、斯里兰卡等国。